Взаимные отношения между Высшими органами аудита двух стран также развиваются быстрыми темпами. Меморандум о сотрудничестве между Счетными палатами Узбекистана и Таджикистана был подписан в 2021 году.

В настоящее время Счетные палаты двух стран являются членами ИНТОСАИ, АЗОСАИ, ЭКОСАИ, Советов Высших органов аудита (ВОА) СНГ и Шанхайской организации сотрудничества (ШОС).

В последние годы состоялись встречи расширенных делегаций сторон в России, Индии, Турции, Казахстане и Египте.

27-31 октября 2025 года в Шарм-эль-Шейхе (Египет), в рамках XXV Конгресса ИНТОСАИ состоялось очередное заседание Совета глав ВОА стран-участниц СНГ. В рамках заседания прошла встреча первого заместителя председателя Счетной палаты Республики Узбекистан М. Абдуллаева и председателя Счетной палаты Республики Таджикистан Дж. Каримзода.

15-16 апреля 2025 года в Душанбе (Таджикистан) состоялось 7-е заседание глав ВОА стран-членов ШОС, в котором принял участие заместитель председателя Счетной палаты Республики Узбекистан С. Мирзаев. На мероприятии узбекская сторона выдвинула ряд предложений по повышению эффективности использования водных ресурсов путем усиления государственного контроля.

Ранее делегации обеих сторон приняли участие в VI заседании глав ВОА государств-членов ШОС, состоявшемся в Лакхнау (Индия) в 2023 г. Заседание было посвящено вопросам «Интеграции новых технологий в процесс аудита».

Аудиторы обоих учреждений также участвовали в международных учебных курсах и семинарах, проходивших в Ташкенте, Астане, Бишкеке, Стамбуле, Осло, Нанкине и др., обмениваясь взаимным профессиональным опытом.

Счетные палаты Узбекистана и Таджикистана установили сотрудничество в области системного изучения методологий государственного аудита и внедрения международных стандартов аудита.

В будущем ВОА Узбекистана и Таджикистана выражают готовность к последовательному развитию сотрудничества и партнерских отношений в рамках двусторонних и международных организаций.

Знания и опыт, полученные в рамках взаимного сотрудничества, будут способствовать развитию государственного финансового контроля на уровне международных стандартов в двух дружественных и братских странах.